药流20天有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.药流不全：药流后子宫内有残留的胚胎组织，会导致子宫持续出血，血液在子宫内停留时间较长，排出时就会呈现褐色。
2.子宫复旧不良：药流后子宫需要一定时间恢复，如果子宫复旧不良，收缩无力，也会导致出血时间延长，出现褐色分泌物。
3.感染：药流后如果不注意个人卫生，或过早进行性生活，容易引起宫腔感染，导致子宫内膜炎等炎症，出现褐色分泌物，并伴有腹痛、发热等症状。
4.其他：药流后内分泌失调、休息不好、劳累等也可能导致褐色分泌物的出现。
需要注意的是，药流后20天仍有褐色分泌物，是异常情况，应及时就医，进行B超等检查，明确原因后，在医生的指导下进行治疗。同时，药流后要注意休息，保持个人卫生，一个月内禁止性生活和盆浴，避免劳累和剧烈运动，饮食上要注意加强营养，促进身体恢复。如果药流后出现出血量多、腹痛剧烈等异常情况，应立即就医。