小儿佝偻病主要是由于维生素D缺乏、日照不足以及饮食中钙摄入不足等原因引起。其中，维生素D缺乏是最主要的病因，约90%以上的小儿佝偻病与维生素D缺乏相关。
维生素D摄入不足
母乳中维生素D含量低： 母乳中维生素D的含量较低，如果婴儿仅以母乳喂养且户外活动少，就容易缺乏维生素D。一般来说，母乳中维生素D的含量约为10 - 80IU/L，单纯母乳喂养的婴儿如果没有额外补充维生素D，在出生后2 - 3个月就可能出现维生素D缺乏的情况。配方奶中维生素D添加不足： 虽然配方奶中会添加维生素D，但如果配方奶中维生素D的添加量不符合标准，或者婴儿摄入配方奶的量不足，也会导致维生素D摄入不够。通常配方奶中维生素D的含量应达到400IU/L左右，如果低于这个标准，就可能引发佝偻病。
日照不足
户外活动少： 小儿如果长期待在室内，接受阳光照射的时间不足，就容易患佝偻病。比如城市中很多孩子因为学业繁忙或者居住环境限制，每天户外活动时间不足1 - 2小时，而人体皮肤中的7 - 脱氢胆固醇经紫外线照射后可转化为维生素D，日照不足会影响维生素D的合成。季节因素影响： 在冬季，日照时间短、强度弱，小儿获得的紫外线照射减少，维生素D合成不足。尤其是北方地区，冬季漫长，小儿更容易因日照不足而患佝偻病。
钙磷代谢紊乱
饮食中钙摄入不足： 婴幼儿时期生长发育迅速，如果饮食中钙含量不足，就会影响骨骼的正常发育。例如，1岁以内的婴儿每天需要摄入300 - 400mg的钙，如果饮食中奶类、豆制品等含钙丰富的食物摄入不够，就可能导致钙缺乏，进而引发佝偻病。疾病影响钙磷代谢： 一些疾病会影响小儿对钙、磷的吸收和利用，从而导致佝偻病。比如胃肠道疾病会影响钙、磷的吸收，慢性肝病会影响维生素D的活化等，这些都可能干扰钙磷代谢，增加小儿患佝偻病的风险。