三岁孩子膝盖疼可能由以下原因引起：
1.生长痛：这是儿童生长发育过程中的一种常见现象，多见于3-12岁儿童，主要与骨骼生长迅速、与局部肌肉筋腱的生长发育不协调有关。疼痛通常发生在傍晚或夜间，位于膝关节周围，无明显红肿，活动正常。一般不需要特殊治疗，可通过按摩、热敷等方式缓解。
2.外伤：孩子在活动或玩耍时，可能会不小心摔倒、碰撞，导致膝盖受伤，引起疼痛。需要注意观察孩子的受伤情况，如有皮肤破损、红肿、活动受限等，应及时就医。
3.感染：如滑膜炎、骨髓炎等，可导致膝盖疼痛。同时可能伴有发热、局部红肿等症状。
4.其他：缺钙、类风湿性关节炎、血友病等也可能引起孩子膝盖疼。
如果孩子膝盖疼持续时间较长、疼痛剧烈、伴有其他症状或影响正常活动，建议及时就医，进行详细的检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，家长应注意观察孩子的情况，让孩子多休息，避免过度活动和剧烈运动。