孩子膝盖疼可能由以下原因引起：
1.生长痛：三岁孩子骨骼生长迅速，可能会导致腿部肌肉酸痛，尤其是膝盖部位。这种疼痛通常在夜间出现，为双侧对称性疼痛，不会影响孩子的活动。
2.外伤：孩子在活动中可能会不小心摔倒或碰撞膝盖，导致受伤。如果受伤后出现红肿、淤青或活动受限，可能是骨折或软组织损伤。
3.感染：如膝关节炎、滑膜炎等，可能由细菌、病毒或其他感染引起。除了膝盖疼痛，还可能伴有发热、红肿等症状。
4.其他疾病：如风湿病、幼年特发性关节炎、白血病等也可能导致孩子膝盖疼。这些疾病通常还会伴有其他症状，如关节肿胀、皮肤紫癜等。
5.缺钙：孩子生长发育迅速，钙摄入不足或吸收不良可能导致缺钙，引起膝盖疼。
如果孩子膝盖疼持续时间较长、疼痛剧烈、影响活动或伴有其他异常症状，建议及时就医。医生通常会进行详细的身体检查、影像学检查等，以确定具体原因并给予相应的治疗。同时，家长可以注意以下几点：
给孩子提供舒适的鞋子，避免穿高跟鞋或硬底鞋。
鼓励孩子多晒太阳，促进钙的吸收。
控制孩子的活动量，避免过度疲劳。
注意孩子的营养均衡，多摄入富含钙和维生素D的食物。
需要注意的是，以上内容仅供参考。如果对孩子的健康状况有任何疑虑，最好咨询专业的医生。