阴茎上面皮肤长小水泡的原因可能有以下几点：
1.感染：
生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起，主要通过性接触传播。感染后，阴茎上面的皮肤会出现水疱、溃疡等症状，并伴有疼痛、瘙痒等不适感。
梅毒：由梅毒螺旋体感染引起，主要通过性接触传播。梅毒感染后，阴茎上面的皮肤也会出现水疱、溃疡等症状，但通常还会伴有其他症状，如发热、头痛、淋巴结肿大等。
其他感染：如尖锐湿疣、传染性软疣等，也可能导致阴茎上面皮肤长小水泡。
2.过敏：
接触性皮炎：如果对某些物质过敏，如避孕套、润滑剂等，可能会导致阴茎上面皮肤过敏，出现水疱、瘙痒等症状。
药物过敏：某些药物，如抗生素、抗癫痫药等，也可能引起过敏反应，导致阴茎上面皮肤长小水泡。
3.其他原因：
生殖器部位的湿疹：湿疹是一种常见的皮肤病，也可能发生在生殖器部位，导致阴茎上面皮肤长小水泡。
生殖器部位的真菌感染：如念珠菌感染等，也可能导致阴茎上面皮肤长小水泡。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体原因需要根据患者的具体情况进行诊断和治疗。如果发现阴茎上面皮肤长小水泡，建议及时就医，以便明确诊断并采取相应的治疗措施。同时，应注意个人卫生，避免搔抓和摩擦，以免加重病情。