包皮上起小疙瘩的原因可能有以下几点：
1.感染：
细菌感染：如金黄色葡萄球菌、链球菌等，可引起包皮龟头炎，导致包皮上出现小疙瘩、红肿、疼痛等症状。
真菌感染：如念珠菌感染，可引起包皮龟头炎或念珠菌性包皮龟头炎，导致包皮上出现红斑、丘疹、水疱等。
病毒感染：如人乳头瘤病毒（HPV）感染，可引起尖锐湿疣，导致包皮上出现菜花状、乳头状的赘生物。
2.过敏：
接触过敏原：如避孕套、润滑剂、某些清洁剂等，可引起过敏反应，导致包皮上出现红肿、瘙痒、小疙瘩等症状。
食物过敏：某些食物，如海鲜、芒果、花生等，也可能引起过敏反应，导致包皮上出现小疙瘩。
3.其他原因：
包皮过长或包茎：包皮过长或包茎时，包皮垢积聚，刺激包皮和龟头，可引起炎症反应，导致包皮上出现小疙瘩。
药物副作用：某些药物，如抗生素、抗抑郁药等，可能引起过敏反应或副作用，导致包皮上出现小疙瘩。
性传播疾病：如梅毒、生殖器疱疹、淋病等，也可能导致包皮上出现小疙瘩。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体原因需要根据患者的具体情况进行诊断和治疗。如果发现包皮上有小疙瘩，建议及时就医，进行相关检查和治疗。同时，要注意个人卫生，保持包皮清洁干燥，避免搔抓和刺激。此外，如果有性伴侣，应同时进行检查和治疗，避免交叉感染。