怀孕40天孕囊的正常大小一般在5mm左右，最大直径通常不超过2cm。需要注意的是，孕囊的大小可能会存在一定的个体差异，这与受孕时间、月经周期以及胚胎发育情况等因素有关。
此外，在怀孕40天时，通过超声检查还可以观察到孕囊内是否有胎芽和胎心搏动，以确定胚胎的发育情况。如果孕囊大小与孕周不符，或者没有胎芽和胎心搏动，需要进一步进行检查和诊断，以排除胎停育等异常情况。
在确认怀孕后，孕妇应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动，同时要保持良好的心态，合理饮食，补充叶酸等营养素。在医生的指导下，按时进行产前检查，以确保自身和胎儿的健康。如果对孕囊大小或其他孕期问题有任何疑问，建议及时咨询医生，以获得专业的建议和指导。