大便时肛门刺痛的原因主要有以下几点：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开后形成的感染性溃疡，是一种常见的肛管疾病。典型表现为肛门疼痛、便秘和出血。初期疼痛为便后一过性灼痛或刀割样疼痛，可伴有肛门裂口出血；后期疼痛为肛门括约肌持续性痉挛引起的疼痛，常持续数小时至十余小时，伴有习惯性便秘和便时滴血。
2.外痔：肛缘皮肤皱襞突起，如水泡样，颜色青紫，便后或蹲厕时变大，轻触即痛，出血少或无出血。
3.肛管炎：长期的粪便刺激和不良的排便习惯，可导致肛管部位产生炎症。主要症状为肛门部下坠感、疼痛、肛管黏膜水肿、出血和瘙痒等。
4.肛周脓肿：是肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿。其特点是自行破溃，或在手术切开引流后常形成肛瘘。肛门周围起病急，初起时肛门肿胀、疼痛，逐渐加重，伴有发热、全身不适等症状。
5.内痔：内痔发展到三期或四期时，痔核可脱出肛门外，由于肛门括约肌的收缩，使其嵌顿于肛门外，形成嵌顿性内痔。临床表现为肛门部肿物脱出、疼痛、瘙痒、便血等。
6.肠道感染或炎症性肠病：如溃疡性结肠炎、克罗恩病等，可导致肠道炎症和溃疡，引起肛门疼痛。
7.其他：肛门周围皮肤感染、性病、肛管或直肠肿瘤等也可能引起肛门刺痛。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要结合个人病史、症状、体征以及进一步的检查来确定。如果肛门刺痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，以便明确诊断并采取适当的治疗措施。