小孩睾丸隐隐作痛是否会自愈，需要根据具体情况来判断。以下是一些可能的原因和处理方法：
1.睾丸扭转：这是一种紧急情况，需要立即就医。睾丸扭转会导致睾丸血液供应中断，如不及时治疗，可能会导致睾丸坏死。睾丸扭转多发生于青春期前的男孩，常见于剧烈运动或睡眠时。表现为突然发生的睾丸剧痛，并逐渐加重，同时伴有恶心、呕吐等症状。
2.附睾炎或睾丸炎：这是儿童常见的阴囊炎症，通常由细菌感染引起。症状包括睾丸疼痛、肿胀、发红等。附睾炎或睾丸炎需要使用抗生素治疗，一般在7-14天内可以痊愈。
3.精索静脉曲张：精索静脉曲张是精索内蔓状静脉丛的异常扩张、伸长和迂曲。多发生于左侧，可导致阴囊内温度升高，影响睾丸生精功能。患儿可能会感到阴囊坠胀、隐痛，久站或步行后症状加重，平卧休息后症状可减轻或缓解。精索静脉曲张可能会影响生育能力，需要手术治疗。
4.其他原因：睾丸损伤、睾丸肿瘤、疝气等也可能导致睾丸疼痛。这些情况通常需要进一步的检查和治疗。
总之，小孩睾丸隐隐作痛需要引起重视，家长应及时带孩子就医，进行详细的检查，以确定病因并采取相应的治疗措施。在等待就医期间，应让孩子尽量休息，避免剧烈运动和长时间站立。同时，要注意观察孩子的症状是否加重，如有异常应及时告知医生。