甲基丙二酸血症患者的存活时间差异较大，受到多种因素影响。
病情严重程度
重型：多数患儿在新生儿或婴儿早期发病，若未得到及时诊断和规范治疗，预后较差，可能在婴儿期因严重代谢性酸中毒、酮症酸中毒等危及生命，存活时间较短，部分患儿可能在数月内死亡。这是因为重型患儿体内甲基丙二酸等代谢产物蓄积严重，对多个器官系统造成严重损害，如神经系统受到严重影响，导致脑损伤等，进而影响呼吸、循环等重要生理功能。
轻型：部分患儿起病较晚，症状相对较轻，通过严格控制饮食等治疗措施，病情可得到较好控制，能够较长时间存活，甚至接近正常人的寿命。轻型患儿体内代谢紊乱程度相对较轻，对器官功能的影响相对较小，只要能严格遵循饮食等治疗方案，维持体内代谢平衡，就可以较好地生存，其生长发育等也能接近正常儿童。
治疗干预情况
早期规范治疗：如果能够在新生儿期通过新生儿筛查等手段早期发现甲基丙二酸血症患儿，并及时开始规范的治疗，包括饮食控制（限制富含甲基丙二酸前体的食物摄入，如富含蛋白质的食物等）、维生素B12等药物治疗等，患儿的预后会相对较好，存活时间也会延长。早期规范治疗可以有效减少体内甲基丙二酸等毒性代谢产物的蓄积，保护器官功能，尤其是神经系统功能，从而提高患儿的生存质量和延长存活时间。
治疗不规范或依从性差：如果患儿家长不重视治疗，不能严格按照医生的要求进行饮食控制和药物治疗，患儿体内代谢产物会持续蓄积，病情会逐渐加重，影响多个器官功能，导致存活时间缩短。例如，若不能严格限制饮食，继续摄入过多的甲基丙二酸前体物质，会使体内代谢紊乱进一步加剧，对神经系统、肝脏、肾脏等造成进行性损害，最终危及生命。
年龄因素
婴儿期：婴儿期是甲基丙二酸血症病情变化较为关键的时期，重型患儿在婴儿期面临的风险最高，而轻型患儿如果护理得当、治疗规范，也有可能度过婴儿期进入儿童期。婴儿期患儿各器官系统发育尚未成熟，对代谢紊乱的耐受性差，一旦代谢产物蓄积就容易出现严重的器官功能障碍。
儿童期及以后：儿童期及以后的患儿，如果病情控制稳定，生长发育相对正常，其存活时间会随着年龄增长而逐渐接近正常人群，但仍需要长期密切监测代谢指标，调整治疗方案。随着年龄增长，患儿的器官功能相对逐渐成熟，对代谢紊乱的耐受性有所提高，但仍需要持续关注代谢情况，因为长期的代谢紊乱仍可能对器官功能产生慢性影响，如对肾脏功能的慢性损害等，所以需要长期的医疗管理。
性别因素
目前并没有明确的证据表明甲基丙二酸血症的存活时间存在明显的性别差异。无论是男性还是女性患儿，其存活时间主要取决于病情严重程度、治疗干预情况等因素。当然，在治疗过程中需要根据患儿的性别特点进行一些特殊的关注，例如在青春期时，女性患儿可能面临月经等生理变化，但这些变化本身一般不会直接影响甲基丙二酸血症的存活时间，主要还是需要关注代谢控制情况对其生长发育等的影响。
生活方式因素
饮食方面：良好的饮食控制是保证甲基丙二酸血症患儿病情稳定的关键生活方式因素。遵循低蛋白饮食等严格的饮食方案，能够有效减少甲基丙二酸前体的摄入，维持代谢平衡。如果患儿不能严格执行饮食方案，随意摄入高蛋白质食物等，会导致病情加重，影响存活时间。例如，经常食用肉类、豆类等富含蛋白质的食物，会使体内产生更多的甲基丙二酸前体物质，进而加重代谢紊乱。
运动和休息：适当的运动有助于患儿的生长发育和身体健康，但要避免过度劳累。合理的休息能够保证患儿身体的正常代谢和恢复。过度运动可能会加重患儿的身体负担，而缺乏休息则会影响身体的代谢调节功能，对甲基丙二酸血症患儿的病情控制不利。例如，过度运动可能导致患儿体内乳酸等代谢产物增加，与甲基丙二酸等代谢产物相互影响，加重代谢紊乱。
病史因素
既往并发症情况：如果患儿既往已经出现过严重的并发症，如严重的酮症酸中毒、脑损伤等，会明显影响其存活时间。既往有严重并发症的患儿，器官功能已经受到较为严重的损害，即使经过治疗，恢复也较为困难，后续再次出现代谢紊乱等情况的风险较高，从而影响存活时间。例如，既往有脑损伤的患儿，可能会存在智力发育落后、运动障碍等问题，同时更容易出现呼吸、循环等方面的并发症。
家族病史：家族中有甲基丙二酸血症患儿的其他成员的病史情况也可能对当前患儿产生一定影响，但主要还是取决于患儿自身的病情和治疗情况。家族病史可以提示遗传因素的影响程度，但患儿自身的病情严重程度和治疗情况才是决定存活时间的关键。如果家族中有类似病情较重的患儿，那么当前患儿需要更加密切地监测和规范治疗，以降低病情加重的风险。