打黄体酮三个月后肿痛，可能与以下原因有关。
1.药物不良反应：黄体酮是一种孕激素，长期使用可能会导致局部组织充血、水肿，从而引起肿痛。这种情况通常是暂时的，停药后会逐渐缓解。
2.局部刺激：如果注射部位不正确、注射速度过快或注射剂量过大，可能会刺激局部组织，引起肿痛。
3.感染：如果注射部位发生感染，也会出现肿痛、发红、发热等症状。
4.其他：乳腺疾病、外伤等也可能导致注射部位肿痛。
如果打黄体酮三个月后肿痛持续不缓解或伴有其他不适症状，建议及时就医，进行相关检查，以明确原因，并采取相应的治疗措施。在注射黄体酮期间，应注意以下几点。
1.选择正确的注射部位：一般选择臀部或上臂三角肌，避免在同一部位重复注射。
2.掌握正确的注射方法：按照医生的指导进行注射，注意注射速度和剂量。
3.注意局部卫生：保持注射部位清洁，避免感染。
4.观察注射后反应：如果出现局部肿痛、发红、发热等不适症状，应及时告知医生。
5.定期复查：按照医生的要求定期进行复查，以便及时发现和处理可能出现的问题。