13价肺炎疫苗主要针对2岁以下婴幼儿等特定人群，可预防13种肺炎球菌血清型引起的感染；23价肺炎疫苗适合2岁以上特定高危人群，能预防23种肺炎球菌血清型的感染。
接种人群差异
13价肺炎疫苗推荐6周龄 - 15月龄婴幼儿接种，也适用于某些特定高危成人。23价肺炎疫苗适合2岁以上肺炎球菌性疾病高危人群，如患有慢性疾病（如心脏病、肺病、糖尿病等）、老年人等。因为婴幼儿免疫系统发育尚不完善，易受肺炎球菌感染，而特定高危成人自身抵抗力相对较弱，感染后风险较高。
覆盖血清型不同
13价肺炎疫苗覆盖的血清型相对较窄，但都是引起婴幼儿侵袭性肺炎球菌疾病最主要的血清型。23价肺炎疫苗覆盖血清型较多，能预防更多种类的肺炎球菌血清型感染，但对于2岁以下婴幼儿保护效果不如13价肺炎疫苗。这是由于婴幼儿免疫系统对多种血清型的应答能力有差异，13价疫苗针对婴幼儿易感染的主要血清型进行了针对性覆盖。
免疫程序不同
13价肺炎疫苗基础免疫通常在2、4、6月龄进行接种，加强免疫在12 - 15月龄进行。23价肺炎疫苗一般只需接种1剂，若免疫功能低下者，可在首次接种5年后加强1剂。不同的免疫程序是根据疫苗刺激机体产生免疫应答的特点以及不同人群的免疫特点来制定的，以达到最佳的免疫保护效果。
保护时效有别
13价肺炎疫苗在婴幼儿体内产生的免疫记忆相对更持久且能较好维持婴幼儿的保护水平。23价肺炎疫苗对于部分人群的保护时效相对13价疫苗可能存在差异，且随着时间推移，保护效果可能会有一定下降。这与疫苗本身的抗原特性以及不同人群的免疫反应特点相关，婴幼儿免疫系统的发育特点使得13价疫苗能在其体内激发更持久有效的免疫保护。
对于婴幼儿接种13价肺炎疫苗时，要确保其身体健康，无发热、急性感染等情况。对于老年人等接种23价肺炎疫苗的人群，要了解自身基础疾病情况，在健康状态下接种，以保障接种安全和效果，不同年龄、健康状况的人群在接种疫苗时需综合自身情况来选择合适的肺炎疫苗。