牙最里面的肉肿起来，可能与以下原因有关：
1.智齿冠周炎：智齿是口腔内牙槽骨上最里面的第三颗磨牙，由于其位置较深，容易食物嵌塞和滋生细菌，导致智齿周围的牙龈发炎、肿胀。此外，智齿生长过程中可能会挤压周围的牙齿和组织，也会引起疼痛和肿胀。
2.牙龈炎：牙龈炎是指牙龈组织的炎症，通常由细菌感染、牙结石、刷牙不当等原因引起。牙龈炎会导致牙龈红肿、出血、疼痛等症状。
3.牙周炎：牙周炎是一种侵犯牙龈和牙周组织的慢性炎症，多由牙龈炎发展而来，逐渐加重。牙周炎会导致牙槽骨吸收、牙齿松动等问题。
4.口腔溃疡：口腔溃疡是一种常见的口腔黏膜疾病，通常表现为口腔黏膜的溃疡性损伤，伴有疼痛。口腔溃疡的原因尚不明确，可能与遗传、免疫、感染等因素有关。
5.肿瘤：口腔内的肿瘤也可能导致牙龈肿胀，如牙龈癌等。
如果牙最里面的肉肿起来，建议及时就医，进行口腔检查和诊断。医生会根据具体情况制定相应的治疗方案，可能包括口腔清洁、使用抗生素、手术治疗等。此外，保持良好的口腔卫生习惯，如正确刷牙、使用牙线等，对于预防口腔疾病也非常重要。