引起3岁宝宝肚子疼的原因有很多，具体原因如下：
1.肠痉挛：这是宝宝肚子疼最常见的原因，大多是由于宝宝吃了过多的食物或者是吃了一些生冷、不易消化的食物导致的。这种情况引起的肚子疼，一般通过按摩或者热敷宝宝的腹部，就可以得到缓解。
2.急性阑尾炎：宝宝的阑尾腔相对较细，阑尾壁又薄，一旦阑尾发生炎症，很容易导致阑尾腔堵塞，从而引起阑尾血液循环障碍，导致阑尾发炎。这种情况引起的肚子疼，初期位于脐周或上腹部，数小时后腹痛转移并固定于右下腹，伴有恶心、呕吐等症状。如果宝宝出现这种情况，家长应及时带宝宝就医。
3.肠套叠：这是一种婴幼儿常见的急腹症，多发生于2岁以下的宝宝。肠套叠多由饮食改变、病毒感染等原因引起肠蠕动节律紊乱所致。这种情况引起的肚子疼，多为突然发作的阵发性腹痛，患儿会表现为阵发性哭闹、面色苍白、出汗、伴有呕吐和果酱样血便。如果宝宝出现这种情况，家长应及时带宝宝就医，在医生的指导下进行治疗。
4.蛔虫症：这是宝宝肚子疼的常见原因之一，多见于3岁至7岁的孩子。由于蛔虫的幼虫在小肠内寄生，会分泌毒素，毒素刺激肠道，肠道蠕动加快，从而引起肚子疼。这种情况引起的肚子疼，一般为阵发性腹痛，多位于脐周或上腹部，疼痛无固定位置，常伴有食欲不振、恶心、呕吐等症状。如果宝宝出现这种情况，家长可以在医生的指导下给宝宝服用驱虫药进行治疗。
5.腹型癫痫：这是一种由于大脑神经元异常放电导致的疾病，多见于儿童和青少年。腹型癫痫的症状主要为突然发作的阵发性腹痛，疼痛部位多位于脐周或上腹部，常伴有恶心、呕吐、腹泻等症状。如果宝宝出现这种情况，家长应及时带宝宝就医，在医生的指导下进行治疗。
6.其他：除了以上几种原因外，宝宝肚子疼还可能与急性胃炎、急性肠炎、痢疾、腹膜炎等疾病有关。如果宝宝肚子疼的症状持续时间较长或者伴有其他症状，家长应及时带宝宝就医，以便明确病因，进行针对性的治疗。