月经来时腰疼肚子疼可能是以下原因导致：
一、经前期综合征：在月经来临前，女性体内激素水平会有变化，其中促性腺激素分泌增多，致使孕激素、雌激素等激素分泌也随之增加，这就可能出现月经来时腰疼肚子疼的状况。一般这种情况会随着月经结束而逐渐消退。
二、盆腔炎：长期不注重个人卫生、有不洁性生活、术后感染等因素都可能诱发盆腔炎。炎症刺激局部，使盆腔内组织容易充血、水肿，进而出现月经来时腰疼肚子疼的现象。
三、子宫腺肌症：通常异位的子宫内膜受周期性激素改变影响，在子宫肌层内弥漫性生长，因反复出血导致子宫肌壁出现粗厚的肌纤维带和有陈旧性血液的微小囊腔，随着月经周期变化，就可能引发周期性腹痛，从而造成月经来时腰疼肚子疼。
如果女性出现月经来时腰疼肚子疼的情况，建议尽早前往医院就诊，明确具体原因，遵医嘱积极治疗。
总结：月经来时腰疼肚子疼可能由经前期综合征、盆腔炎、子宫腺肌症等引起，出现该情况应及时就医检查和治疗。