缺铁性贫血引起的原因有多种。人体每天约有0.02%的红细胞更新，而铁是合成血红蛋白的关键原料，当铁摄入不足或丢失过多等情况出现时，就容易引发缺铁性贫血。
铁摄入不足方面
饮食结构不合理： 一些人群存在长期偏食、挑食的情况，比如儿童如果不爱吃富含铁的食物，像红肉（牛肉、猪肉等）、动物肝脏、豆类等，就会导致铁摄入不足。正常情况下，1岁 - 3岁的幼儿每天需要摄入约7mg铁，4岁 - 6岁每天约需要10mg铁，如果长期达不到这个摄入量，就容易引发缺铁性贫血。特殊人群需求大却摄入少： 孕妇对铁的需求量比普通女性要高，孕妇每天需要约27mg铁来满足自身和胎儿的需求，但如果孕期饮食中铁的补充不够，就很容易出现缺铁性贫血。比如有的孕妇孕吐严重，影响了正常饮食，又没有及时通过其他途径补充足够的铁，就容易陷入铁摄入不足的状况。
铁丢失过多方面
慢性失血： 胃肠道慢性失血是常见原因，像患有胃溃疡的病人，胃部会持续少量出血，长期下来就会丢失较多铁。据统计，胃溃疡患者如果长期不愈，每月可能丢失约1 - 2mg铁，长期积累就会引发缺铁性贫血。月经过多： 女性月经量过多也会导致铁丢失。正常女性每次月经失血量约30ml - 50ml，失铁量约15mg - 25mg，如果月经量过多，比如某些女性患有子宫肌瘤等疾病，导致月经量明显多于正常范围，每月失铁量可能达到30mg以上，长期如此就容易引发缺铁性贫血。
铁吸收障碍方面
胃肠道疾病影响： 一些胃肠道疾病会影响铁的吸收，比如患有克罗恩病的患者，肠道的正常结构和功能受到破坏，会影响铁的吸收。克罗恩病患者的肠道对铁的吸收效率会大幅下降，正常肠道对铁的吸收率约为10% - 20%，而这类患者可能吸收率不足5%。药物干扰： 某些药物也会干扰铁的吸收，比如长期服用质子泵抑制剂（如奥美拉唑等），会抑制胃酸分泌，而胃酸有助于铁的溶解和吸收，胃酸减少就会影响铁的吸收。长期服用这类药物的人，铁的吸收会受到明显影响，时间长了就可能引发缺铁性贫血。