缺铁性贫血主要是体内铁缺乏导致的。铁摄入不足是常见原因之一，比如婴幼儿在4-6个月后，从母体获得的铁逐渐耗尽，若饮食中没有及时补充富含铁的食物，像红肉、豆类等，就容易引发缺铁性贫血。一般婴幼儿每天需要摄入一定量的铁来满足生长需求，如果未能得到充足供应，就可能慢慢出现缺铁情况。
铁丢失过多
慢性失血：这是很重要的一个因素。比如胃溃疡患者，会长期少量失血，血液中的铁随着粪便排出体外，长期积累就会导致缺铁性贫血。还有女性月经过多，正常女性月经失血一般较少，但如果存在子宫肌瘤等情况，月经过多，每月丢失的铁量较多，也会引起缺铁性贫血。一般每次月经失血量如果超过80毫升，就可能增加缺铁性贫血的风险。肠道寄生虫感染：像钩虫感染，钩虫会吸附在肠道黏膜上，导致肠道慢性失血，进而引起缺铁性贫血。钩虫在肠道内寄生，会破坏肠道黏膜，造成持续的微量出血，长期下来铁丢失过多就会引发贫血。
铁吸收障碍
胃肠道疾病：一些胃肠道疾病会影响铁的吸收。比如萎缩性胃炎，胃黏膜萎缩，胃酸分泌减少，而胃酸是帮助铁解离和吸收的重要因素，胃酸不足就会影响铁的吸收。还有做了胃大部切除的患者，术后胃的结构和功能发生改变，铁的吸收也会受到影响。另外，小肠疾病，如克罗恩病，会影响小肠对铁的正常吸收过程，导致铁吸收障碍，从而引发缺铁性贫血。饮食搭配不合理：如果长期饮食中同时摄入影响铁吸收的物质，也会导致铁吸收障碍。比如长期大量喝咖啡或浓茶，咖啡和茶中的鞣酸会与铁结合，形成不溶性的复合物，阻碍铁的吸收。正常情况下，鞣酸会干扰铁在肠道内的吸收过程，使得铁的吸收效率大大降低。