宝宝在睡着时咳嗽厉害的原因包括以下几种。
一、咳嗽变异性哮喘：其临床症状特点是夜间咳嗽较为明显，可能还伴有湿疹等表现。对此的治疗需要用到布地奈德混悬吸入剂和特布他林吸入剂等药物进行雾化吸入治疗。
二、上气道咳嗽综合征：表现为夜间咳嗽明显，同时伴有鼻塞、喷嚏、流涕等鼻炎症状，还可能出现睡觉张口呼吸、睡觉打呼噜等腺样体肥大症状。鼻炎、腺样体肥大在睡觉时由于分泌物滴入咽部甚至到气管，就会引发咳嗽。需要给予糠酸莫米松鼻喷剂喷鼻腔治疗，若效果不佳则要配合孟鲁司特钠片口服进行治疗。
三、感染后咳嗽：也可能出现夜间咳嗽厉害的情况，如果是细菌感染则口服抗生素，如果是病毒感染则对症治疗，必要时可以进行雾化吸入治疗。
四、胃食道返流：夜间咳嗽较多，这是由于返流问题所导致的。
当宝宝睡着了咳嗽厉害时，一定要去医院就诊，查明原因后进行针对性治疗，切不可擅自用药，以防出现不良后果。