发烧后口腔溃疡多是由身体免疫力下降引发的。研究表明，当人体发烧时，免疫系统处于相对紊乱状态，此时口腔内的局部防御能力减弱，容易受到病菌侵袭从而引发口腔溃疡，大约有30% - 50%的发烧患者会出现口腔溃疡情况。
一、身体免疫力变化导致
发烧影响免疫细胞活性： 发烧时，体内的免疫细胞活性会受到一定影响。比如T淋巴细胞等免疫细胞的功能会暂时下降，使得口腔黏膜抵御病原体的能力降低。正常情况下，免疫细胞能及时清除口腔内的有害病菌，维持口腔黏膜的健康，但发烧时这种清除能力变弱，就为口腔溃疡的发生创造了条件。免疫平衡被打破： 发烧会打破身体原本的免疫平衡状态。人体在正常状态下，免疫系统处于一种动态的平衡，以保障身体各部位的正常功能。而发烧时，这种平衡被打破，使得口腔黏膜组织更容易受到病菌的感染，进而引发口腔溃疡。
二、维生素缺乏相关因素
发烧影响维生素吸收： 发烧时，人体的新陈代谢加快，身体对营养物质的消耗增加，同时胃肠道的消化吸收功能也可能受到一定影响。例如，维生素B族等对于维持口腔黏膜健康至关重要的营养素，其吸收可能会减少。如果本身平时饮食中维生素摄入就不够，发烧时这种情况会更加明显，从而增加口腔溃疡的发生几率。发烧导致维生素流失： 发烧时，人体通过出汗等方式会使部分维生素流失。比如维生素C等水溶性维生素，在出汗过程中会随着汗液排出体外，使得口腔黏膜缺乏足够的营养支持，容易出现溃疡。
三、病毒感染直接作用
常见疱疹病毒活跃： 像单纯疱疹病毒等在人体发烧时容易活跃起来。当人体发烧后，身体抵抗力下降，潜伏在体内的单纯疱疹病毒就可能被激活。这些病毒会侵袭口腔黏膜细胞，导致口腔黏膜出现炎症反应，进而形成口腔溃疡。一般在发烧后的1 - 2天内，就可能观察到口腔黏膜开始出现小的疱疹，随后发展为溃疡。病毒破坏黏膜组织： 单纯疱疹病毒等感染口腔黏膜后，会在黏膜细胞内大量复制，破坏黏膜细胞的正常结构和功能。使口腔黏膜的完整性受到破坏，出现破损、溃烂等情况，表现为口腔溃疡，且溃疡部位可能伴有疼痛、红肿等症状。