三岁小孩脸上起小米粒疙瘩，可能是由以下原因引起的：
1.粟丘疹：
粟丘疹是一种起源于表皮或附属器上皮的潴留性囊肿，可发生于任何年龄、性别，也可发生于任何部位，但通常好发于眼睑、颊部及额部。
临床表现为坚实的丘疹，表面光滑，呈肤色或淡黄色，可逐渐增大。
一般无自觉症状，通常不需要治疗，如果影响美观或出现感染等情况，可以通过消毒后用针挑破表皮，剔出内容物，然后涂以红霉素软膏等进行治疗。
2.湿疹：
湿疹是由多种内外因素引起的皮肤炎症反应，可发生于任何年龄、部位，常对称分布。
临床表现为多形性皮疹，有渗出倾向，伴有瘙痒。
治疗上主要是寻找病因，避免各种可疑的致病因素，如避免热水洗烫、过度搔抓、避免接触可能致敏的物质等。同时，根据病情的严重程度，选择合适的治疗方法，如外用糖皮质激素、抗组胺药等。
3.痤疮：
痤疮是一种毛囊皮脂腺的慢性炎症性疾病，好发于青少年，也可发生于成年人。
临床表现为粉刺、丘疹、脓疱、结节、囊肿等多种损害。
治疗上主要是注意皮肤清洁，常用温水洗脸，避免挤压和搔抓，少吃油腻、辛辣刺激性食物，多吃新鲜蔬菜和水果。同时，根据病情的严重程度，选择合适的治疗方法，如外用维A酸乳膏、过氧化苯甲酰凝胶等。
4.传染性软疣：
传染性软疣是由传染性软疣病毒感染引起的一种传染性皮肤病，可通过直接接触或间接接触传播。
临床表现为米粒至豌豆大小的半球形丘疹，表面有蜡样光泽，中央有脐凹，可挤出白色乳酪样物质。
治疗上主要是用消毒后的镊子将疣体挤出或挑出，然后涂以碘酊等进行治疗。
5.其他：
如蚊虫叮咬、药物疹、皮肤过敏等也可导致脸上起小米粒疙瘩。
总之，三岁小孩脸上起小米粒疙瘩的原因较多，如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医，明确诊断后进行治疗。