三岁小孩脸上起小米粒疙瘩，可能是由以下原因引起的：
1.粟丘疹：这是一种起源于表皮或附属器上皮的潴留性囊肿，可发生于任何年龄，新生儿和成年人都可能出现。通常表现为坚实的丘疹，表面光滑，呈肤色或淡黄色。这种情况一般不需要治疗，可自行消退。
2.湿疹：湿疹是一种由多种内外因素引起的皮肤炎症反应，可发生于任何年龄。湿疹的皮疹表现多样，可能会出现红斑、丘疹、水疱、渗出、结痂等。湿疹的发生与过敏、环境、遗传等因素有关。治疗湿疹需要根据具体情况采取相应的措施，如保持皮肤清洁、使用保湿剂、外用糖皮质激素等。
3.痤疮：痤疮是一种常见的毛囊皮脂腺慢性炎症性疾病，好发于青少年。痤疮的皮疹表现为粉刺、丘疹、脓疱、结节、囊肿等。痤疮的发生与雄激素水平、皮脂腺分泌增加、毛囊皮脂腺导管角化异常、痤疮丙酸杆菌感染等因素有关。治疗痤疮需要综合考虑病因、病情严重程度等因素，采取相应的措施，如外用药物（如维A酸乳膏、过氧化苯甲酰凝胶等）、口服药物（如抗生素、异维A酸等）、光疗等。
4.传染性软疣：传染性软疣是由传染性软疣病毒感染引起的一种传染性皮肤病，可通过直接接触或间接接触传播。传染性软疣的皮疹表现为米粒至豌豆大小的半球形丘疹，中央有脐凹，可挤出白色乳酪样物质。治疗传染性软疣通常采用刮除术或挤出法去除疣体，也可使用冷冻、激光等方法治疗。
5.其他原因：三岁小孩脸上起小米粒疙瘩还可能与其他原因有关，如蚊虫叮咬、皮肤感染、药物疹等。
需要注意的是，由于引起三岁小孩脸上起小米粒疙瘩的原因较多，且有些疾病可能会影响小孩的健康，因此建议及时带小孩到医院就诊，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长应注意保持小孩皮肤清洁，避免搔抓皮疹，避免接触过敏原，避免使用刺激性的护肤品和化妆品。