三岁小孩脸上起小米粒疙瘩，可能是由以下原因引起的：
1.湿疹：
湿疹是一种常见的皮肤炎症，可能与过敏、遗传、环境等因素有关。湿疹可导致皮肤发红、肿胀、起疹子，有时会有渗出和结痂。湿疹通常会反复发作，可能在脸部、头皮、手臂、腿部等部位出现。除了小米粒疙瘩外，还可能伴有瘙痒、疼痛等症状。
2.痱子：
痱子是由于汗腺堵塞引起的皮肤炎症。当小孩出汗过多，汗腺无法正常排出时，就容易在皮肤表面形成痱子。痱子通常出现在颈部、腋窝、肘窝、腹股沟等部位，也可能出现在脸部。痱子会导致皮肤出现小红疹或小水疱，有时会伴有瘙痒感。
3.痤疮：
痤疮是一种常见的皮肤病，通常发生在青少年身上，但也可能在儿童时期出现。痤疮的原因是皮脂腺分泌过多油脂，导致毛孔堵塞。痤疮可导致脸部、背部、胸部等部位出现粉刺、丘疹、脓疱等症状。
4.过敏：
过敏是一种免疫系统反应异常引起的疾病。当小孩接触到过敏原时，就可能发生过敏反应，导致皮肤出现红肿、瘙痒、起疹子等症状。过敏原可能包括食物、花粉、动物毛发、尘螨等。
5.其他原因：
除了上述原因外，三岁小孩脸上起小米粒疙瘩还可能是由其他原因引起的，如病毒感染、细菌感染、寄生虫感染等。
如果小孩脸上的小米粒疙瘩持续不消失或伴有其他症状，如瘙痒、疼痛、发热等，建议及时就医，以便明确诊断并采取相应的治疗措施。同时，家长应注意保持小孩皮肤清洁，避免过度摩擦和刺激，避免使用刺激性的化妆品和护肤品。如果不确定原因，最好避免自行用药或处理，以免加重症状。