舌头上起溃疡的原因有多种。一般来说，约20% - 30%的人会受到复发性阿弗他溃疡的困扰，而这种溃疡的发生与多种因素相关。
局部创伤因素
口腔内不良刺激： 比如牙齿的残根、残冠，会不断摩擦舌头黏膜，从而容易引发溃疡。如果牙齿有尖锐的边缘，长期刺激舌头，就可能在相应部位形成溃疡。另外，佩戴不合适的假牙，假牙的边缘不贴合，也会反复摩擦舌头，导致溃疡出现。
营养不良因素
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素B12、叶酸等维生素时，容易引发舌溃疡。例如，长期挑食、节食的人，很可能摄入维生素不足。以维生素B12为例，它参与人体的细胞代谢等多种生理过程，缺乏时会影响黏膜的正常修复，进而导致舌溃疡发生。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素缺乏也与舌溃疡有关。锌参与人体多种酶的合成，对维持黏膜的完整性很重要，当体内锌含量不足时，舌黏膜的抵抗力下降，就容易长溃疡。
免疫系统因素
自身免疫反应： 当人体免疫系统出现紊乱时，就可能攻击自身的黏膜组织，引发舌溃疡。比如患有白塞病的患者，除了舌溃疡外，还可能伴有眼部、生殖器等部位的溃疡，这就是自身免疫功能异常导致的。免疫力低下： 当人体处于疲劳、睡眠不足、患有某些慢性疾病等状态时，免疫力会下降，此时就更容易受到病原体的侵袭，引发舌溃疡。例如，长期熬夜的人，身体免疫力降低，舌头上长溃疡的概率会增加。
其他因素
精神因素： 长期的精神紧张、焦虑、压力过大等，会影响人体的神经内分泌系统，进而干扰黏膜的正常代谢，导致舌溃疡。比如学生在考试期间，由于精神高度紧张，可能会出现舌溃疡的情况。内分泌变化： 女性在月经周期前后，体内的激素水平会发生变化，这可能会诱发舌溃疡。还有一些女性在妊娠期，也可能因为内分泌的改变而出现舌溃疡。