小脚趾头肉肿一碰就疼可能由多种原因引起，比如甲沟炎，这是比较常见的情况。一般来说，甲沟炎多是由于指甲修剪不当、局部外伤等导致细菌感染引起，发病率在足部疾病中占一定比例。
一、外伤因素导致
鞋子挤压： 如果长时间穿不合脚的鞋子，尤其是鞋子过紧，小脚趾受到反复挤压，就容易引起局部软组织损伤，出现肉肿且一碰就疼的情况。比如长时间行走后，小脚趾被鞋子反复摩擦挤压，就可能引发这种症状。重物砸伤： 小脚趾如果被重物砸到，不管是重物直接砸中还是碰撞到，都可能造成局部软组织损伤甚至骨折，进而出现肉肿、疼痛，这种情况在运动损伤或者意外事故中较为常见。
二、感染因素导致
细菌感染： 小脚趾部位皮肤有破损时，细菌容易侵入引发感染。像常见的金黄色葡萄球菌感染，会导致局部红肿热痛。比如脚部出汗多，卫生状况不佳，小脚趾皮肤有微小破损，就可能被细菌感染，出现肉肿一碰就疼的现象。真菌感染： 足癣如果没有及时治疗，病情加重时也可能波及小脚趾部位，引起局部炎症反应，出现肉肿、疼痛等症状。足癣在人群中有一定的发生率，尤其是多汗体质的人更容易患足癣。
三、关节炎相关因素导致
痛风性关节炎： 血尿酸水平升高，尿酸盐结晶沉积在小脚趾关节周围时，会引起急性炎症反应，导致小脚趾肉肿、疼痛，而且疼痛较为剧烈。痛风在中老年人群中相对常见，尤其是有高嘌呤饮食等不良生活习惯的人。类风湿关节炎： 这是一种自身免疫性疾病，也可能累及小脚趾关节，导致关节周围组织肿胀、疼痛，病情逐渐发展可能会影响关节功能。类风湿关节炎的发病年龄较广，各年龄段都有可能患病。