黄体功能不全可以通过多种方式来判断，首先可以从月经情况来初步判断，一般黄体功能不全的女性月经周期可能会缩短，比如原本月经周期是30天，现在可能缩短到21-25天左右。
通过症状表现判断
月经异常表现： 除了月经周期缩短，还可能出现月经量少，或者月经前点滴出血的情况。有些女性在月经前几天就会有少量阴道出血，然后才正式来月经。不孕或流产表现： 因为黄体功能不全影响受精卵着床，所以部分女性可能会出现不孕的情况。即使成功受孕，也容易发生早期流产，有数据显示，约有30% - 40%因黄体功能不全导致的不孕女性会发生早期流产。
通过血液检查判断
性激素六项检查： 在月经周期的黄体期（一般是月经周期的第22 - 24天左右）抽血检查性激素六项。如果孕酮水平低于正常范围，比如孕酮值小于15nmol/L，就提示可能存在黄体功能不全。同时，还可以看雌二醇水平，如果雌二醇水平也偏低，也可能与黄体功能不全有关。
通过子宫内膜活检判断
活检时间： 在月经周期的第26 - 28天进行子宫内膜活检。正常情况下，此时子宫内膜应该呈分泌期改变。如果活检结果显示子宫内膜分泌反应落后于实际月经周期天数2天以上，那就提示黄体功能不全。例如，月经周期第28天活检，子宫内膜还停留在分泌早期的状态，就说明黄体功能不足，影响了子宫内膜的正常分泌转化。