脐疝主要是由于肚脐部位的腹壁组织发育不完善或存在薄弱点导致的。在婴儿中较为常见，约有5%的早产儿和1/3的超低体重儿会发生脐疝。
先天发育因素：
胎儿时期的脐环未闭：胎儿在发育过程中，肚脐部位的脐环应该在出生前闭合。如果脐环没有正常闭合，就为脐疝的形成提供了基础。一般足月儿出生时脐环多已闭合，而早产儿由于发育相对不成熟，脐环闭合不全的情况更易发生。腹壁肌肉薄弱：婴儿的腹壁肌肉还处于发育阶段，相对比较薄弱，尤其是脐周围的肌肉力量不足，无法很好地维持腹腔内容物的正常位置，当腹腔内压力增高时，就容易导致腹腔内的肠管等组织从脐部薄弱处突出形成脐疝。
后天因素影响：
腹腔内压力增高：一些情况会使婴儿腹腔内压力升高，比如过度哭闹，婴儿长时间哭闹时，腹腔内压力会明显增加，促使脐疝更容易发生；便秘也是常见原因，婴儿排便困难时用力屏气，导致腹腔内压力上升，推动肠道等组织突出脐部；还有剧烈咳嗽等情况，也会使腹腔内压力瞬间增高，增加脐疝出现的几率。疾病因素：某些疾病也可能间接导致脐疝，如患有先天性甲状腺功能减退症的婴儿，由于代谢等方面的异常，可能会影响身体的正常发育，包括腹壁肌肉的发育，从而增加脐疝发生风险；另外，患有一些会导致腹部胀气的消化道疾病时，也可能引发腹腔内压力变化，诱发脐疝。
其他情况：
成人脐疝原因：对于成人来说，脐疝多与腹壁组织退变有关，随着年龄增长，腹壁的弹性纤维等组织逐渐老化、脆弱。此外，肥胖也是成人脐疝的一个重要诱因，肥胖者腹部脂肪堆积较多，腹腔内压力相对较高，加上腹壁组织承受的压力增大，容易导致脐部薄弱处发生疝。还有一些成人可能有慢性咳嗽、慢性便秘等病史，长期腹腔内压力增高，也会促使脐疝形成。