月经总是不干净可能由多种原因引起，比如子宫肌瘤，据统计，30岁以上女性约20%患子宫肌瘤，它会使子宫收缩异常，导致月经淋漓不尽。
一、妇科疾病因素
1. 子宫肌瘤： 子宫肌瘤是子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，除了月经不干净，还可能出现经量增多、下腹包块等症状。黏膜下子宫肌瘤对月经的影响较为明显，会干扰子宫的正常收缩，导致经期延长、经量增多。2. 子宫内膜息肉： 子宫内膜局部过度生长所致，患者可出现月经间期出血、月经过多、经期延长等表现。息肉较小的时候可能没有明显症状，较大的息肉就容易影响子宫内膜的正常修复，从而引起月经不干净。
二、内分泌失调因素
1. 黄体功能不全： 女性黄体期孕激素分泌不足或黄体过早衰退，会导致子宫内膜分泌反应不良和黄体期缩短。患者主要表现为月经周期缩短、月经频发，也可能出现月经干净后又少量出血的情况，使得月经总是不干净。一般来说，育龄期女性比较容易出现黄体功能不全的问题。2. 甲状腺功能异常： 甲状腺激素对女性的内分泌系统有重要调节作用。甲状腺功能减退时，机体代谢减缓，会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，导致月经紊乱，出现月经经期延长、淋漓不尽等表现；甲状腺功能亢进时，也可能引起内分泌失调，影响月经的正常周期和经期，导致月经总是不干净。
三、其他因素
1. 宫内节育器影响： 部分女性放置宫内节育器后，可能会出现月经不干净的情况，一般在放置后的3 - 6个月内比较常见。这是因为节育器作为一种异物，刺激子宫内膜，引起子宫收缩异常，导致经期延长、经量增多或月经淋漓不尽。2. 全身性疾病： 像血小板减少性紫癜、白血病等血液系统疾病，会影响凝血功能，从而导致月经总是不干净。还有一些肝脏疾病，会影响雌激素的代谢，也可能引起月经紊乱，出现经期延长的现象。