男性肾阳虚多由多种因素长期作用所致。一般来说，年龄增长是一个重要因素，随着年龄增加，男性到了一定阶段（如40岁以后），肾阳会逐渐衰退。另外，长期过度劳累也易引发肾阳虚，比如一些男性长期从事高强度体力劳动或脑力劳动，消耗过多体力和精力，就可能损伤肾阳。还有不良生活习惯也是常见原因，像长期熬夜，长期熬夜会打乱人体生物钟，影响肾脏功能，久而久之易导致肾阳虚；再比如长期吸烟酗酒，烟草中的有害物质和酒精都会对肾脏等器官产生损害，影响肾阳的正常功能。
先天因素影响
遗传体质： 如果男性先天禀赋不足，肾脏阳气亏虚，就更容易出现肾阳虚的情况。比如家族中有肾阳不足的遗传倾向，那么后代男性相对来说患肾阳虚的几率可能会比一般人高一些。母体孕期影响： 母亲在孕期如果遭受不良刺激，如严重营养不良、感染疾病等，也可能影响胎儿先天的肾阳状况，导致男性出生后相对更容易出现肾阳虚问题。
疾病损伤肾阳
慢性疾病消耗： 一些慢性疾病会长期消耗人体正气，其中就包括肾阳。例如患有慢性肾炎、糖尿病等慢性疾病的男性，疾病长期迁延不愈，会不断损耗肾阳。以慢性肾炎为例，肾脏长期处于炎症状态，影响肾脏的正常功能，包括肾阳的温煦等功能，进而引发肾阳虚。外感寒邪入侵： 长期处于寒冷潮湿的环境中，或者经常受凉，寒邪容易侵袭人体，若寒邪长期停留体内损伤肾阳，也会导致男性肾阳虚。比如在寒冷的环境中工作时间过长，没有做好保暖措施，寒邪就会慢慢伤及肾阳，出现腰膝冷痛、畏寒怕冷等肾阳虚的表现。
不当用药伤及肾阳
滥用苦寒药物： 一些男性在生病时，不恰当使用苦寒性质的药物，可能会损伤肾阳。比如长期服用清热解毒的苦寒中药，像黄连、黄芩等，如果使用不当或过量，就可能影响肾脏阳气的功能。因为苦寒药物易伤阳气，长期使用会慢慢损耗肾阳，从而引发肾阳虚的一系列症状。误用泻药： 不合理地使用泻药，也可能对肾阳造成损害。有些男性为了减肥等不合理目的滥用泻药，泻药会过度排泄人体的津液和阳气，其中就包括肾阳，长此以往会导致肾阳虚的发生。