子宫内膜增生主要是由于体内雌激素水平失衡等多种因素引起的。正常情况下，子宫内膜会在雌激素作用下发生周期性变化，若雌激素长期刺激，缺乏孕激素拮抗，就容易导致子宫内膜增生。
一、内分泌失调因素
雌激素持续刺激： 当身体内分泌出现紊乱时，如多囊卵巢综合征患者，体内雄激素水平升高，会刺激下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴，导致雌激素分泌异常增多，长期过量的雌激素不断作用于子宫内膜，就容易引发子宫内膜增生。据统计，约有30%的子宫内膜增生与多囊卵巢综合征相关。孕激素缺乏或作用不足： 孕激素的主要作用是使增生期的子宫内膜转化为分泌期，如果孕激素分泌不足或者子宫内膜对孕激素不敏感，也就是孕激素作用不足，那么子宫内膜就会持续处于增生状态，进而导致子宫内膜增生。比如一些长期不排卵的女性，由于没有排卵就不会产生足量的孕激素，容易出现子宫内膜增生。
二、疾病相关因素
肥胖因素： 肥胖女性体内脂肪较多，脂肪会将雄激素转化为雌激素，使得体内雌激素水平升高。有研究发现，肥胖女性患子宫内膜增生的风险比正常体重女性高出约2 - 3倍。例如，体重指数（BMI）大于30的肥胖女性，发生子宫内膜增生的几率明显增加。内分泌功能性肿瘤： 如卵巢颗粒细胞瘤、卵泡膜细胞瘤等内分泌功能性肿瘤，会持续分泌雌激素，导致体内雌激素水平异常升高，从而刺激子宫内膜过度增生。这类肿瘤虽然相对少见，但也是引起子宫内膜增生的一个重要病因。
三、外源性激素影响因素
长期服用雌激素类药物： 有些女性为了美容等目的长期自行服用含有雌激素的保健品，或者因医疗需要长期服用雌激素类药物，如不规范使用雌激素替代疗法等，都会使体内雌激素水平升高，进而引发子宫内膜增生。一般来说，长期单独使用雌激素超过半年以上，就可能增加子宫内膜增生的发生风险。服用含有雌激素的避孕药物： 部分女性长期服用含有雌激素的复方避孕药，如果服用方法不规范或者本身对药物中的雌激素敏感，也可能导致体内雌激素水平失衡，引起子宫内膜增生。不过，这种情况相对其他外源性激素影响的几率相对较低，但也不可忽视。