灰指甲主要是由皮肤癣菌感染引起的，约95%的灰指甲是由皮肤癣菌导致的。
感染途径一：直接接触传染
与患者密切接触：比如和患有灰指甲的人握手、共用毛巾、拖鞋等，皮肤癣菌就有可能从接触部位侵入人体，从而引发感染。像在家庭生活中，如果家人有灰指甲，共用拖鞋就很容易让其他人被感染。接触污染物品：在公共浴室、游泳馆等公共场所，接触到被皮肤癣菌污染的地面、毛巾等物品，也有感染灰指甲的风险。因为这些地方环境潮湿，适合皮肤癣菌存活，一旦接触到就可能被传染。
感染途径二：自身其他部位真菌蔓延
手部其他癣病蔓延：比如患有手癣的人，手部的皮肤癣菌可能会蔓延到指甲部位，引起灰指甲。手癣和灰指甲都是由皮肤癣菌引起的，它们之间相互关联，手癣不及时治疗很容易波及到指甲。脚部其他癣病蔓延：有脚气（足癣）的人，脚部的真菌也可能慢慢侵袭到脚趾甲，导致灰指甲。足癣是常见的脚部真菌疾病，长期不愈就可能引发指甲感染。
易患人群特点
免疫力低下者：比如糖尿病患者、长期使用免疫抑制剂的人等，他们的身体免疫力相对较低，更容易受到皮肤癣菌的侵袭，从而增加患灰指甲的几率。糖尿病患者由于血糖控制不佳，皮肤和甲床的抵抗力下降，容易被真菌感染。指甲有外伤者：指甲受到外伤后，皮肤的屏障功能受损，皮肤癣菌更容易侵入指甲周围的组织，进而引发灰指甲。比如经常从事体力劳动，指甲容易受到磕碰、挤压等外伤的人，就比较容易患上灰指甲。老年人：随着年龄增长，老年人的指甲会发生生理性变化，指甲变得比较脆弱，而且血液循环相对较差，皮肤癣菌更容易在指甲部位定植，所以老年人患灰指甲的比例相对较高。