肺栓塞主要临床表现多样，其中呼吸困难较为常见，约占80%，这是因为肺栓塞会影响肺部的气体交换功能。
呼吸困难表现
突发性呼吸困难： 往往是突然发生，患者会感觉气不够用，呼吸急促，可能在活动后或休息时都出现。例如一些患者在日常轻微活动后就明显感觉喘气困难。活动后加重： 随着活动量增加，呼吸困难会更明显，比如原本能走几百米不喘，患肺栓塞后可能走几十米就气喘吁吁。
胸痛表现
胸膜炎样胸痛： 约占40% - 70%，疼痛多与呼吸有关，深吸气时胸痛加重。这种疼痛是因为肺组织缺血缺氧刺激胸膜导致。心绞痛样胸痛： 约占40%，疼痛性质类似心绞痛，可能是因为肺栓塞引起冠状动脉痉挛，心肌供血不足所致，疼痛程度不一，有的较剧烈。
咯血表现
小量咯血： 常见，咯血量一般较少，多为痰中带血。这是因为肺栓塞后肺组织缺血坏死，肺泡内出血导致。大咯血少见但严重： 虽然大咯血相对少见，但一旦发生较为严重，可能是肺栓塞累及较大血管，引起肺部血管破裂出血。
晕厥表现
部分患者会出现： 约占11% - 20%，可能是肺栓塞导致心输出量急剧减少，脑供血不足引起。比如一些患者在活动过程中突然出现眼前发黑、晕倒的情况。