慢性肠胃炎的症状表现多样。一般来说，患者可能会有反复发作的腹痛，疼痛程度不一，多数为隐痛或胀痛，发作时间不定，可能持续数分钟到数小时不等。
消化系统症状方面
腹痛： 慢性肠胃炎常见的症状之一，多位于上腹部，疼痛性质多样，有的患者表现为隐痛，有的是胀痛，疼痛程度轻重不同，发作没有固定的时间规律，可能持续几分钟到几小时不等。腹泻： 大便次数会增多，一般每天可能会有3 - 5次甚至更多，大便的性状也会改变，可能是稀便、糊状便等，有的患者还可能伴有黏液便，不过黏液量一般不会太多。
全身症状表现
乏力： 患者可能会经常感觉全身没有力气，精神状态较差，影响日常生活和工作，这种乏力感可能会持续存在，并且会随着病情的变化有所波动。消瘦： 如果病情长期没有得到有效控制，部分患者可能会出现体重下降、消瘦的情况，这是因为胃肠道消化吸收功能受到影响，营养物质不能被很好地吸收利用。
其他伴随症状
食欲减退： 患者对食物的兴趣会降低，食量可能会减少，看到食物没有明显的进食欲望，长期如此可能会进一步加重身体的不适和营养状况的不良。恶心呕吐： 部分慢性肠胃炎患者会出现恶心的感觉，严重时可能会伴有呕吐，尤其是在进食某些不合适的食物后，呕吐症状可能会更明显。