口舌生疮的原因有多种。一般来说，约有20% - 30%的人群会受到复发性阿弗他溃疡的困扰，而口舌生疮常见的原因包括以下几方面。
缺乏营养素
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素B₂时，容易引发口舌生疮。比如长期挑食、偏食的人，很可能导致维生素B₂摄入不足。还有维生素B₁₂缺乏也可能与口舌生疮有关，这类人群往往存在胃肠道吸收障碍等问题。微量元素缺乏： 像锌元素缺乏时，会影响人体的免疫功能和细胞的正常代谢，从而增加口舌生疮的发生几率。一些素食者如果膳食结构不合理，就可能出现锌摄入不足的情况。
免疫力下降
疾病因素： 患有某些慢性疾病时，如糖尿病患者，由于血糖控制不佳，机体抵抗力下降，容易反复出现口舌生疮。还有像艾滋病患者，其免疫系统受到严重破坏，也常常会有口舌生疮的表现。劳累熬夜： 长期熬夜、过度劳累会使人体免疫力降低。比如连续熬夜加班后，很多人会发现口腔内出现溃疡，这就是因为身体疲劳，免疫力下降，让口腔内的病菌有了可乘之机。
口腔局部刺激
创伤性因素： 牙齿的残冠、残根或者不合适的假牙等，会不断摩擦口腔黏膜，从而导致口舌生疮。例如有尖锐牙尖的人，吃饭时不小心就可能划伤口腔黏膜，进而引发溃疡。不良习惯： 喜欢吃辛辣、过烫的食物，也容易刺激口腔黏膜，引起口舌生疮。比如冬天喜欢吃滚烫火锅的人，口腔黏膜很容易被烫伤，之后就可能发展为溃疡。