人体真菌感染的症状因感染部位不同而有所差异。比如皮肤真菌感染，常见的体癣，会在感染部位出现圆形或椭圆形的红斑，边缘有丘疹、水疱，伴有瘙痒，有的患者瘙痒感可能持续数周甚至数月。
皮肤真菌感染症状
体癣表现： 通常是单个或多个红色斑块，边界清晰，周边炎症明显，中心可能有自愈倾向，形成环状。而且在潮湿多汗的部位，如腹股沟、腋窝等，更容易发生体癣，并且瘙痒感较为明显，严重时会影响日常活动和睡眠。手足癣表现： 手足癣分为水疱型、鳞屑角化型和浸渍糜烂型。水疱型手足癣会在手指间、手掌、足底出现深在性水疱，瘙痒剧烈；鳞屑角化型则表现为皮肤干燥、增厚、脱屑，冬季容易皲裂疼痛；浸渍糜烂型多发生在指（趾）缝，皮肤浸渍发白，除去白皮后基底潮红，可能会有渗液。
深部真菌感染症状（以肺部为例）
肺部真菌感染： 轻症患者可能没有明显症状，或仅有轻微咳嗽，类似普通感冒。而重症患者会出现发热，体温可高达38℃~39℃甚至更高，伴有咳嗽、咳痰，痰液可为白色黏痰或脓性痰，有的患者还会有呼吸困难的表现，活动后气促明显，严重时会影响呼吸功能，需要吸氧等治疗。
口腔真菌感染症状
口腔念珠菌感染： 最常见的是鹅口疮，多见于婴幼儿，口腔黏膜上会出现白色斑膜，像凝乳状，不易擦去，强行擦去后局部会有潮红、糜烂。成人也可能发生，常见于长期使用抗生素、激素的人群，口腔内会有口干、烧灼感、疼痛等症状，影响进食。