灰指甲主要是由皮肤癣菌感染引起的，约95%的灰指甲是皮肤癣菌导致的。
感染途径一：直接接触传染
与患者密切接触：比如和患有灰指甲的人握手、共用毛巾、拖鞋等，就有可能被感染。如果家里有人有灰指甲，在日常生活中不注意隔离，很容易让其他人被传染。接触污染物品：在公共浴室、游泳池等公共场所，接触了被真菌污染的地面、毛巾等物品，也有感染灰指甲的风险。比如公共浴室的地面，如果之前有灰指甲患者走过，脚上的真菌可能就留在地面上，其他人接触后就可能被感染。
感染途径二：自身其他部位真菌感染蔓延
手足癣蔓延：如果本身患有手足癣，没有及时治疗，真菌就可能蔓延到指甲，引发灰指甲。因为手足癣和灰指甲的致病菌很多时候是一样的，比如红色毛癣菌。患者手部患有严重的手癣时，真菌可能会慢慢侵蚀指甲周围的皮肤，进而感染指甲。体癣等其他癣病传播：身体其他部位患有体癣等癣病，真菌也有可能传播到指甲，导致灰指甲。比如患有股癣的人，搔抓患处后再接触指甲，就可能把真菌带到指甲上引起感染。
感染途径三：自身免疫因素影响
免疫力低下人群：老年人、糖尿病患者、长期使用免疫抑制剂的人等，由于自身免疫力较低，更容易感染真菌引发灰指甲。比如糖尿病患者，因为血糖控制不好，身体的抵抗力下降，皮肤和甲床更容易受到真菌的侵袭。老年人随着年龄增长，身体各项机能衰退，免疫力也会降低，相对来说更容易患上灰指甲。