慢性肠胃炎常见的症状表现多样。一般来说，患者可能会有长达数月甚至数年的腹部不适。
消化系统症状表现
腹痛：多数患者会出现腹部隐痛，疼痛部位多在肚脐周围，疼痛程度不一，有的是轻微胀痛，有的可能是间歇性的钝痛。腹泻：大便次数增多是常见表现，每天可能会排便3 - 5次甚至更多，大便质地稀薄，严重时可能呈水样便，但也有的患者会出现腹泻与便秘交替的情况。
全身症状表现
乏力：由于肠胃功能紊乱，营养吸收受到影响，患者容易感到全身乏力，精神状态较差，日常活动容易疲倦。消瘦：长期的慢性肠胃炎会影响食物的消化吸收，导致身体摄入的营养不足，进而出现体重下降、消瘦的情况，如果病情持续时间较长，体重可能会有较明显的降低。
其他伴随症状表现
恶心呕吐：部分慢性肠胃炎患者会有恶心的感觉，严重时可能会出现呕吐，尤其是在进食某些刺激性食物后，呕吐症状可能会加重。食欲不振：患者往往没有明显的饥饿感，对食物的兴趣降低，进食量减少，长期如此会进一步影响身体的营养状况。
不同人群的特殊表现
儿童慢性肠胃炎：除了上述常见症状外，儿童可能还会出现生长发育迟缓的情况，因为肠胃功能不好会影响营养的摄取，从而影响身体的正常生长。老年慢性肠胃炎：老年患者可能症状相对不典型，除了消化系统症状外，更容易出现脱水、电解质紊乱等情况，因为老年人的身体机能相对较弱，对肠胃不适引起的水分和电解质丢失的调节能力较差。