慢性肠胃炎的症状表现多样。一般来说，患者可能会有长达数月甚至数年的不适症状。
消化系统症状表现
腹痛： 多数患者会出现腹部隐痛，疼痛位置不固定，一般在肚脐周围或上腹部。疼痛程度轻重不一，有的患者是轻微的胀痛，有的可能会有阵发性的绞痛感。腹泻： 大便次数增多是常见症状，每天可能会排便3 - 5次甚至更多，大便质地较稀，可为糊状便或水样便。部分患者还可能伴有黏液便，大便中可见少量黏液。
全身症状表现
乏力： 由于肠胃功能长期受影响，营养吸收不良，患者容易感到全身乏力，精神状态较差，活动耐力下降。体重减轻： 长期慢性肠胃炎会影响食物的消化吸收，导致机体摄入的营养不能充分被利用，进而出现体重逐渐减轻的情况，如果病情持续不改善，体重可能会有较明显的下降。
其他相关症状表现
恶心呕吐： 部分慢性肠胃炎患者会有恶心的感觉，严重时可能会出现呕吐症状，呕吐物多为胃内的容物，一般为未消化的食物。食欲减退： 患者常常会出现食欲下降的情况，对食物缺乏兴趣，进食量明显减少，这也会进一步影响营养的摄入，加重身体的不适。