肛周脓肿主要是由肛腺感染引起的，约90%的肛周脓肿与肛腺阻塞感染有关。比如肛腺管被粪便等异物堵塞，导致分泌物引流不畅，细菌就容易在肛腺内滋生繁殖，进而引发感染，感染向周围组织蔓延就可能形成肛周脓肿。
肛腺感染相关因素
肛腺本身特点：肛腺位于直肠肛管周围，是一种管状结构，容易被粪便等污染。当粪便中的细菌进入肛腺管后，很容易在里面定植。例如，长期便秘的人，粪便干结，在排出过程中更容易损伤肛腺管，增加感染风险。局部卫生问题：如果肛门局部卫生状况差，细菌更容易在肛周滋生。比如不经常清洗肛门，粪便残留等情况，会使肛腺感染的概率大大增加。像一些卫生习惯不好的人群，就比注重肛门清洁的人更易患上肛周脓肿。
肛周皮肤损伤因素
外伤导致：肛门周围受到外伤，比如被异物划伤、摩擦伤等，皮肤的完整性被破坏，细菌就有了可乘之机。例如，进行肛门检查时操作不当造成的轻微损伤，若没有及时处理，也可能引发感染进而形成肛周脓肿。搔抓等不良习惯：有些人会因为肛门瘙痒而搔抓肛周皮肤，这也可能导致皮肤破损，引发感染。比如患有肛门湿疹的患者，瘙痒明显，过度搔抓就容易损伤肛周皮肤，增加肛周脓肿的发生几率。
全身性疾病因素
糖尿病患者：糖尿病患者由于血糖水平较高，身体的抵抗力相对较低。高血糖环境有利于细菌生长繁殖，所以糖尿病患者更容易发生肛周感染，进而引发肛周脓肿。据统计，糖尿病患者患肛周脓肿的概率比正常人要高2 - 3倍。免疫功能低下人群：像艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂的人等，他们的免疫系统功能受到影响，对细菌等病原体的抵御能力减弱。例如，长期使用糖皮质激素治疗疾病的患者，免疫功能被抑制，容易发生各种感染，肛周脓肿就是其中一种可能的感染表现。