肛周脓肿形成的原因主要与肛腺感染、肛门损伤以及身体免疫力下降等因素有关。据临床统计，约90%的肛周脓肿是由肛腺感染引发的。
肛腺感染导致
肛窦感染： 肛窦位于肛门瓣下方，形似小口袋，容易积存粪便和细菌。当肛窦受到细菌感染时，炎症会蔓延至肛腺。例如，腹泻或便秘时，粪便容易擦伤肛窦，从而引发感染。肛腺阻塞： 肛腺分泌的液体有助于润滑肠道，但如果肛腺导管被堵塞，分泌液无法正常排出，就会在腺体内积聚，为细菌繁殖创造条件，进而引发感染并向周围组织扩散，形成肛周脓肿。
肛门损伤引发
外伤磕碰： 如久坐导致肛门局部长时间受压，或者外力撞击肛门部位，都可能造成肛门组织损伤，使细菌容易侵入受损部位引发感染。比如长时间骑自行车的人，就较容易因局部摩擦损伤而增加肛周脓肿风险。医源性损伤： 一些医疗操作也可能导致肛门损伤进而引发感染。例如，肠镜检查时，如果操作不当，可能会损伤肛门直肠黏膜，若细菌趁机侵入，就可能引发肛周脓肿。
身体免疫力下降所致
糖尿病患者： 糖尿病患者由于血糖控制不佳，身体抵抗力相对较低，容易受到细菌侵袭。据研究，糖尿病患者发生肛周脓肿的概率比正常人高2~3倍。这类患者一旦出现肛门周围感染，更容易发展为肛周脓肿且病情可能较难控制。长期使用免疫抑制剂者： 像接受器官移植后需要长期服用免疫抑制剂的患者，其免疫系统功能受到抑制，对细菌的抵御能力减弱，肛周部位容易受到细菌感染，进而引发肛周脓肿。