每天早上肚子疼大便后就好可能是正常生理现象，也可能是饮食不当、慢性肠炎等原因导致。
一、生理现象：早晨时肠道蠕动会有所增加，排便的意识往往比较强烈，所以可能会出现腹部疼痛的情况，而在排便后疼痛通常会消失，这属于正常现象。
二、饮食不当：如果经常食用一些刺激性食物，如辣椒或者冰镇饮料等，就可能会对肠胃造成刺激，从而致使早晨起来出现腹痛甚至腹泻的状况。通过改掉不良饮食习惯，一般能够在一定程度上得到改善。
三、慢性肠炎：慢性肠炎主要表现为腹部疼痛、腹胀以及腹泻等。可以依据医生的指导使用益生菌类药物或者黄连素等药物进行治疗。
此外，还有可能是慢性胃炎等原因引起。可以到医院进行相关检查以明确诊断。总之，当出现这种情况时，要注意观察，必要时寻求专业医生的帮助进行准确判断和合理治疗。