干燥综合征的病因目前尚未完全明确，一般认为是遗传、感染和免疫等多种因素共同作用导致的。据研究，遗传因素在其中起到一定作用，大约10% - 15%的干燥综合征患者有家族遗传倾向。
遗传因素相关
基因关联：某些人类白细胞抗原（HLA）基因与干燥综合征的发病密切相关，比如HLA - DR3、HLA - DRW52等基因，携带这些基因的人群患干燥综合征的风险相对较高。家族聚集性：如果家族中有亲属患有干燥综合征，那么其他家庭成员患病的概率比普通人群要高一些，但并非一定会发病，只是遗传易感性增加。
感染因素影响
病毒感染：EB病毒、丙型肝炎病毒等可能与干燥综合征的发病有关。例如，EB病毒感染可能会激活人体的免疫细胞，导致免疫调节紊乱，进而引发干燥综合征相关的免疫反应。研究发现，部分干燥综合征患者体内可检测到EB病毒的相关抗体。细菌感染：某些细菌感染也可能参与了干燥综合征的发病过程。不过相对病毒感染来说，其具体的作用机制还在进一步研究中，但已有一些证据表明细菌感染可能通过刺激免疫系统，促使干燥综合征的发生发展。
免疫因素作用
自身免疫紊乱：人体的免疫系统会错误地攻击自身的腺体组织，尤其是唾液腺和泪腺。正常情况下，免疫系统能够识别自身和非自身物质，但是在干燥综合征患者体内，免疫系统出现异常，产生了多种自身抗体，如抗SSA抗体、抗SSB抗体等。这些自身抗体攻击唾液腺和泪腺的细胞，导致腺体分泌功能下降，出现口干、眼干等干燥综合征的典型症状。细胞免疫异常：T淋巴细胞等免疫细胞在干燥综合征的发病中也发挥着重要作用。异常的T淋巴细胞会参与对腺体组织的免疫损伤，导致腺体结构和功能的破坏，进一步加重干燥综合征的病情。