干燥综合征的病因目前尚未完全明确，一般认为是遗传、感染和免疫等多种因素共同作用导致的。据研究，遗传因素在其中起到一定作用，约10%的干燥综合征患者有家族史。
遗传因素相关
基因关联： 某些基因的突变或遗传多态性与干燥综合征的发生有关。比如人类白细胞抗原（HLA）基因，尤其是HLA-DR3、HLA-DR4等基因位点，与干燥综合征的易感性增加相关。携带这些基因的人群相对更容易患上干燥综合征，但并非携带就一定会发病，只是患病风险有所升高。
感染因素影响
病毒感染： 有研究发现，EB病毒、丙型肝炎病毒等可能与干燥综合征的发病有关。EB病毒感染可能会激活B淋巴细胞，导致其异常增殖和抗体产生，进而引发自身免疫反应。丙型肝炎病毒感染后，也可能通过免疫机制诱导机体产生自身抗体，参与干燥综合征的病理过程。例如，部分干燥综合征患者体内可检测到与丙型肝炎病毒相关的抗体。细菌感染： 某些细菌感染也可能对干燥综合征的发病起到一定作用。比如幽门螺杆菌感染，有研究提示幽门螺杆菌感染可能通过分子模拟等机制，诱发自身免疫反应，与干燥综合征的发生存在一定关联，但具体机制还需进一步深入研究。
免疫因素作用
自身免疫反应： 干燥综合征是一种自身免疫性疾病，患者体内存在多种自身抗体，如抗SSA抗体、抗SSB抗体等。这些自身抗体攻击自身的唾液腺、泪腺等外分泌腺体，导致腺体破坏，出现口干、眼干等症状。同时，免疫系统中的T淋巴细胞等也参与了免疫损伤过程，使得免疫调节失衡，进一步加重了腺体的损伤和功能障碍。例如，抗SSA抗体和抗SSB抗体在干燥综合征患者中的阳性率较高，对疾病的诊断有重要意义。