干燥综合征是一种自身免疫性疾病，其发病原因目前尚未完全明确，但有多种因素可能与之相关。一般认为遗传因素在其中起到一定作用，据研究，约10% - 40%的干燥综合征患者有家族遗传倾向，存在某些特定基因的人群患病风险相对较高。
遗传因素方面：
基因易感性： 一些人类白细胞抗原（HLA）基因与干燥综合征的发病密切相关，比如HLA - DR3、HLA - DR4等基因位点，携带这些基因的人群患干燥综合征的概率比正常人群要高。家族聚集性： 如果家族中有亲属患有干燥综合征，那么其他家庭成员患病的可能性会比没有家族史的人高出数倍，这提示遗传因素在疾病的发生中起到了重要的基础作用。
免疫因素方面：
免疫系统异常激活： 患者的免疫系统会错误地攻击自身的外分泌腺体，尤其是唾液腺和泪腺。正常情况下，免疫系统能够识别和清除外来的病原体等异物，但在干燥综合征患者体内，免疫系统出现紊乱，B淋巴细胞过度增殖，产生大量自身抗体，如抗SSA抗体、抗SSB抗体等，这些自身抗体攻击唾液腺和泪腺的细胞，导致腺体功能受损，出现口干、眼干等症状。细胞免疫异常： T淋巴细胞也参与了疾病的发生发展过程，T细胞的功能失调会进一步影响B细胞的活性，使得自身抗体的产生持续存在，加重腺体的损伤。
病毒感染因素方面：
病毒可能的触发作用： 某些病毒，如EB病毒、丙型肝炎病毒等，可能会触发干燥综合征的发病。当人体感染这些病毒后，病毒可能会改变人体自身细胞的结构和抗原性，从而激活免疫系统，引发自身免疫反应攻击外分泌腺体。例如，EB病毒感染可能会导致B淋巴细胞的异常活化，进而促使自身抗体的产生，增加患干燥综合征的风险。不过，目前还不是完全明确病毒感染就是直接导致干燥综合征的原因，但病毒感染被认为是可能的诱发因素之一。