肝内胆管结石的症状表现多样，部分患者可能没有明显症状，而有些患者会出现腹部疼痛等情况。比如，约有1/3的患者可能长期没有明显不适症状，仅在体检时被发现。
腹部疼痛表现
右上腹隐痛： 这是比较常见的症状之一，疼痛程度不一，可能是间歇性的隐痛，一般持续时间较短，数分钟到数十分钟不等。患者可能会感觉右上腹有隐隐的胀痛或钝痛，在进食油腻食物后可能会加重。右上腹绞痛： 部分患者会出现右上腹的剧烈绞痛，疼痛如刀割样，这是因为结石移动刺激胆管引起胆管痉挛导致的。这种绞痛可能会突然发作，疼痛较为剧烈，患者往往难以忍受，还可能向右肩部或背部放射。
消化系统症状
恶心呕吐： 当肝内胆管结石引起胆管梗阻时，可能会影响胆汁的正常排泄，进而导致消化系统出现反应，出现恶心、呕吐的症状。呕吐物多为胃内容物，呕吐后症状可能不会立即缓解。食欲不振： 患者可能会感觉食欲下降，对食物的兴趣减低，不想进食，尤其是油腻食物，这是因为胆汁排泄不畅影响了脂肪的消化，从而导致食欲不振。
黄疸表现
皮肤巩膜黄染： 如果肝内胆管结石导致胆管梗阻，胆汁排泄受阻，胆红素反流入血，就会出现黄疸症状，表现为皮肤和巩膜发黄。一般黄疸程度有轻有重，轻度黄疸可能仅表现为皮肤微微发黄，重度黄疸则皮肤黄染较为明显。同时，患者可能还会伴有尿色加深，呈浓茶色，而粪便颜色可能会变浅，呈陶土色。