睡觉两肩膀疼可能由多种原因引起。比如长时间保持不良睡姿，像整晚侧卧且肩膀受压，就可能导致肩膀疼，这种情况较为常见。
姿势不良导致
睡眠姿势不当： 如果长期习惯侧卧睡眠，而且睡眠过程中肩膀一直处于被压迫的状态，持续时间较长时，就容易引起肩膀局部血液循环不畅，从而出现疼痛。一般这种情况通过调整睡姿，避免肩膀长时间受压，疼痛可能会逐渐缓解。床垫不合适： 床垫过硬或过软都可能影响睡眠时肩膀的舒适状态。过硬的床垫不能很好地贴合身体曲线，肩膀部位受力不均匀；过软的床垫会使身体下沉过度，肩膀肌肉难以放松，长时间睡眠后也可能引发肩膀疼痛。比如床垫使用超过10年，弹性和支撑性下降，就比较容易出现这种问题。
肩部疾病引发
肩周炎： 肩周炎患者在睡觉时，肩部肌肉放松，炎症部位受到的限制相对减小，但仍可能因姿势等因素刺激炎症部位而出现疼痛，尤其在夜间可能疼痛较为明显。这种病多见于50岁左右的人群，但现在年轻人由于长期伏案等原因也有发病趋势。肩袖损伤： 肩袖是肩部的重要结构，若发生损伤，睡眠时肩膀处于某个特定位置，可能会刺激损伤部位，导致疼痛。肩袖损伤可能是由于外伤或长期过度使用肩部引起的。
颈椎问题影响
颈椎病： 当颈椎发生病变，如颈椎间盘突出等，压迫到支配肩部的神经时，就可能引起肩膀疼痛，这种疼痛在睡眠时可能因颈部姿势改变而加重。据统计，长期低头工作的人群中，约有30%可能存在不同程度的颈椎病相关肩部疼痛问题。颈椎骨质增生： 颈椎骨质增生会刺激周围组织，包括神经等，也可能导致肩膀疼痛，睡眠时如果颈部姿势不合适，会加重对神经等的刺激，从而引发或加重肩膀疼痛。
其他因素导致
风湿性关节炎： 风湿性关节炎是一种自身免疫性疾病，会累及肩部关节，导致肩膀疼痛，且疼痛可能在清晨或睡眠后加重，活动后有所缓解。这种疾病多发生在寒冷、潮湿的环境中，且病情有反复发作的特点。肩部受凉： 睡眠时肩部暴露在外，长时间受凉，会使肩部肌肉痉挛，血液循环减慢，进而引起肩膀疼痛。比如在空调房睡觉，没有盖好肩部，就容易出现这种情况。