肝功能异常通常由多种因素引起。比如，约有10% - 15%的病毒性肝炎患者会出现肝功能异常情况，其中常见的病毒性肝炎包括甲型肝炎、乙型肝炎等。
一、病毒性因素
肝炎病毒感染： 甲型肝炎病毒感染后，人体免疫系统会对被感染的肝细胞发起攻击，可能导致肝功能异常，通常在感染后1 - 3个月内可能出现转氨酶升高等肝功能异常表现。乙型肝炎病毒持续在肝细胞内复制，会引发免疫炎症反应，破坏肝细胞，进而造成肝功能异常，部分慢性乙肝患者会长期存在肝功能指标异常。其他病毒感染： 像巨细胞病毒、EB病毒等感染也可能影响肝功能，巨细胞病毒感染在婴幼儿中较为常见，可引起肝功能损伤，出现胆红素升高等情况；EB病毒感染可能导致传染性单核细胞增多症，同时伴有肝功能异常，表现为转氨酶升高等。
二、药物性因素
常见致肝损伤药物： 一些抗生素如异烟肼，长期或过量使用时，约有10% - 20%的患者会出现肝功能异常，表现为转氨酶升高；抗癫痫药物如苯妥英钠，也可能引起肝功能损害，导致胆红素、转氨酶等指标异常。药物肝损伤机制： 有些药物是通过代谢产物对肝细胞有毒性作用，从而损伤肝细胞，影响肝功能；还有些药物是引发免疫反应，导致肝细胞被破坏，出现肝功能异常。比如某些降脂药，可能通过干扰肝细胞内的代谢过程，造成肝功能异常。
三、酒精性因素
长期大量饮酒影响： 长期大量饮酒，每天酒精摄入量超过40克（女性超过20克），持续5年以上，就容易引发酒精性肝病，导致肝功能异常。酒精进入人体后主要在肝脏代谢，乙醇代谢产生的乙醛对肝细胞有直接毒性作用，会损伤肝细胞，使肝细胞变性、坏死，进而影响肝功能，出现转氨酶升高、胆红素升高等情况。短期大量饮酒风险： 短期内大量饮酒，如一次饮用大量高度白酒，也可能引起急性酒精性肝炎，导致肝功能急剧异常，出现明显的肝功能指标异常变化。
四、自身免疫性因素
自身免疫性肝炎： 这是一种由自身免疫反应介导的肝脏炎症性疾病，多发于女性，发病机制是自身免疫系统错误地攻击肝细胞，导致肝细胞受损，引起肝功能异常，患者常伴有自身抗体阳性，如抗核抗体、抗平滑肌抗体等阳性，同时有转氨酶升高等肝功能指标异常。其他自身免疫性疾病累及肝脏： 像系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，也可能累及肝脏，引发肝功能异常，其原因是自身免疫反应波及肝脏，导致肝细胞损伤，出现肝功能相关指标的改变。