灰指甲常用的有效药物主要有外用和口服两类。一般来说，外用药物如阿莫罗芬搽剂等，每周使用1-2次，坚持使用数月可能有效果；口服药物如伊曲康唑胶囊等，需要按疗程服用，通常需要几个月时间。
外用抗真菌药物
阿莫罗芬搽剂： 它是局部外用的抗真菌药，通过抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成发挥作用。使用时要先清洁病甲，然后将搽剂均匀涂抹在病甲及周围皮肤上，每周使用1-2次。一般需要连续使用几个月，直到新甲长出。不过，对于比较严重的灰指甲，单独使用外用搽剂效果可能相对慢一些。环吡酮胺乳膏： 也属于外用抗真菌药，能渗透进入真菌细胞内，影响其核酸代谢，从而起到杀菌作用。使用时涂抹在病甲处，每天1-2次。但它的渗透能力相对有限，对于病甲增厚严重的情况，可能需要结合其他治疗方法。
口服抗真菌药物
伊曲康唑胶囊： 是一种口服的广谱抗真菌药，它可以干扰真菌细胞色素P450的活性，抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成。服用方法通常是冲击疗法，即每月服用一周，连续服用几个月。比如第一个月第1、8、15天各服200mg，第二个月同样第1、8、15天服200mg等，但在服药前需要检查肝功能，因为它可能对肝脏有一定影响，肝功能异常者慎用。特比萘芬片： 也是口服抗真菌药，它能特异性地抑制真菌角鲨烯环氧化酶，阻碍真菌细胞膜麦角固醇的合成，从而发挥杀菌作用。一般是每天口服250mg，连续服用的时间根据病甲情况而定，通常手指甲灰指甲需要服用6-12周，脚趾甲灰指甲需要服用12-16周。不过，同样要注意肝功能情况，有肝病病史或肝功能异常者要谨慎使用。
联合治疗情况
有时候为了提高疗效，会采用外用和口服药物联合治疗的方式。比如先外用抗真菌药物软化病甲，然后再配合口服抗真菌药，这样可以加快病甲的改善。但联合治疗时要注意药物之间的相互作用以及对身体的影响，必须在医生的指导下进行，医生会根据患者的具体情况，如灰指甲的严重程度、患者的肝肾功能等综合判断选择合适的治疗方案。同时，在治疗过程中要定期复查，观察治疗效果和药物的不良反应。