总胆固醇低可能由多种原因引起。一般来说，总胆固醇水平低于 3.12mmol/L 可视为总胆固醇低。
可能的生理性原因
饮食因素：长期摄入低脂肪、低胆固醇的食物，比如几乎只吃蔬菜、水果，很少吃肉类、蛋类等富含胆固醇的食物，就可能导致总胆固醇低。例如，有些人过度节食减肥，只吃青菜、水果，这种情况下就容易出现总胆固醇偏低的情况。个体差异：部分人群天生胆固醇合成能力较低，身体代谢胆固醇的速度相对较快，也可能出现总胆固醇低的情况。比如一些新陈代谢比较旺盛的年轻人，身体对胆固醇的消耗大于合成，总胆固醇水平可能处于较低水平。
病理性原因
肝脏疾病： 患有严重的肝脏疾病时，如肝硬化，肝脏合成胆固醇的功能会受到影响，导致总胆固醇降低。因为肝脏是合成胆固醇的主要场所，肝脏病变会使合成能力下降。内分泌疾病： 甲状腺功能亢进症患者，甲状腺素分泌过多，会加速体内物质的代谢，包括胆固醇的代谢，使得总胆固醇降低。还有肾上腺皮质功能减退症，也可能影响胆固醇的合成与代谢，导致总胆固醇水平偏低。
其他因素
恶性肿瘤： 一些恶性肿瘤患者，由于机体处于消耗状态，代谢紊乱，会影响胆固醇的合成与代谢，从而出现总胆固醇低的情况。例如晚期癌症患者，身体状况较差，容易出现总胆固醇偏低现象。长期营养不良： 除了饮食中胆固醇摄入不足，长期营养不良还会影响身体的整体代谢功能，包括胆固醇的代谢，进而导致总胆固醇水平降低。比如一些长期患有慢性消耗性疾病且营养摄入不均衡的人，就可能出现总胆固醇低的情况。