总胆固醇低可能由多种原因引起。一般来说，总胆固醇水平低于2.8mmol/L可视为总胆固醇低。
饮食因素导致
摄入不足： 如果日常饮食中脂肪类食物摄取过少，比如长期吃素且油脂摄入极少，就可能造成总胆固醇低。像一些严格的素食者，如果不注意通过其他途径补充足够的脂类相关营养，就容易出现这种情况。营养不良： 长期营养不良会影响胆固醇的合成。比如蛋白质摄入严重不足时，身体合成胆固醇的原料和相关代谢途径会受到影响，进而导致总胆固醇降低。
疾病因素影响
甲状腺功能亢进： 患有甲状腺功能亢进时，身体代谢会加快，胆固醇的分解代谢也会增强，从而使总胆固醇水平降低。研究发现，约有20% - 30%的甲亢患者会出现总胆固醇低的情况。肝脏疾病： 肝脏是合成胆固醇的重要器官，当发生严重肝病时，如肝硬化，肝脏合成胆固醇的能力下降，就会导致总胆固醇低。另外，肝炎活动期也可能影响胆固醇的合成与代谢，引起总胆固醇水平降低。
其他因素作用
年龄与性别： 一般来说，年轻人总胆固醇水平相对较高，随着年龄增长，尤其是女性绝经后，总胆固醇水平可能会有所降低。比如老年女性总胆固醇低的概率比年轻女性相对要高一些。药物影响： 某些药物也可能导致总胆固醇低，例如一些降脂药如果使用不当，可能会过度抑制胆固醇合成，从而引起总胆固醇降低。还有些抗癫痫药物等也可能对胆固醇代谢产生影响，导致总胆固醇水平偏低。