巨细胞病毒感染的症状因感染人群不同而有所差异。对于健康成年人，多数感染后无明显症状，部分人可能出现类似感冒的表现，如发热（体温可在38℃左右）、乏力、肌肉酸痛等，持续时间可能较短，几天到几周不等。
婴儿感染巨细胞病毒的症状
先天性感染： 部分婴儿在出生时就已感染巨细胞病毒，可能出现生长发育迟缓、黄疸（皮肤和巩膜发黄）、肝脾肿大等症状。有些婴儿还可能有血小板减少性紫癜（皮肤出现瘀点、瘀斑），表现为皮肤有小红点或紫色斑点。围生期感染： 婴儿在出生过程中或出生后不久感染，多数无明显症状，少数可能出现轻微的肝炎表现，如肝功能轻度异常，或有轻度的呼吸道症状，像咳嗽等，但一般症状较轻微，可能在数周内逐渐缓解。
免疫功能低下人群感染巨细胞病毒的症状
器官移植受者： 比如肾移植、肝移植等患者，感染巨细胞病毒后可能出现发热、肺炎症状，表现为咳嗽、气促，严重时会影响呼吸功能，胸部影像学检查可能发现肺部有炎症阴影。还可能出现胃肠道症状，如腹痛、腹泻等，影响营养吸收。艾滋病患者： 当艾滋病患者免疫系统严重受损时，感染巨细胞病毒可引起多系统病变。眼部感染时会出现视力下降，甚至失明，因为巨细胞病毒可能侵犯视网膜；胃肠道感染会导致严重的腹泻，每日腹泻次数可达数次至十余次，严重影响患者的营养状况和生活质量；中枢神经系统受累时可出现头痛、意识障碍等症状。
成人原发性巨细胞病毒感染的症状
发热与全身不适： 成人初次感染巨细胞病毒时，常出现发热，体温一般在37.5℃ - 39℃之间，同时伴有全身乏力、肌肉酸痛，感觉身体疲惫，活动耐力下降。呼吸道症状： 部分患者会有呼吸道症状，如咽痛、咳嗽，咳嗽可能为干咳或伴有少量白痰，严重时咳嗽会影响睡眠和日常生活。淋巴结肿大： 颈部、腋窝等部位的淋巴结可能肿大，用手触摸能感觉到皮下有可活动的肿块，一般无明显疼痛，但肿大的淋巴结可能会持续数周甚至数月。